בעלי עסקים רבים שואלים את עצמם מהו המועד הנכון לביצוע בדיקות פוליגרף למהימנות העובדים בעסק. האם לאחר שקרה כבר אירוע המצריך בדיקת פוליגרף ? או שמה טרם קבלת עובדים לעסק ?
ישנם הטוענים כי בעדיפות ראשונה בדיקת הפוליגרף תתבצע עוד בטרם החל העובד בעבודתו וזאת בכדי למנוע מצב שבו העובד פוטר ממקום עבודה קודם עקב גנבה או מעילה, דבר שיתגלה בבדיקת העובד בפוליגרף וזאת טרם החל בעבודתו ובכך ימנע נזק לעסק. אחרים טוענים כי יש לבדוק רק לאחר שהעובד החל בעבודתו וזאת בכדי למנוע מצב של הרגשת חוסר אמון מצד המעביד דבר שיכול להשפיע לרעה על העובד.
בבואי להשיב לשאלות אלו תחילה אחלק את העובדים על פי הנגישות לקופת העסק , למלאי או למידע חסוי. בקבלת עובד לעסק שבו יש לו נגישות לקופת העסק למזומנים ולמלאי עסקי (נהגים או מחסנאים ) יש לדרוש מן המועמד לבצע בדיקת פוליגרף עוד בשלב המיון וזאת על מנת לסנן את עובדים שעברם גנבו ומעלו את המעסיק.
עובד בחברות כדוגמת חברות הייטק שבה מפתחים מוצרים חדשים חשוב ביותר לשמור על סודיות שם יש לבצע בדיקות פוליגרף למועמדים עוד בטרם החלו לעבוד בכדי למנוע מהם גישה לחומר חסוי וזאת על מנת לשלול את החשד כי עובד זה מנסה להסתנן לעסק על מנת להדליף מידע על פיתוחים חדשים וכו'.
במקרים אחרים בהם הגישה לקופת העסק או למלאי הינה שולית יש לבצע את הבדיקה במהלך העסקתו של העובד כחלק מנוהל קבוע כדי למנוע גנבות או מעילות. מומלץ לבצע בדיקות מהימנות כל חצי שנה לעובד עם גישה לקופת העסק או למלאי ובדיקת פוליגרף כל שנה לעובדים ללא גישה לקופה או למלאי .