השלב האחרון המפריד בין המתכנת המותש, שמאחוריו שעות רבות של פיתוח, ובין עלייתה לאוויר של מערכת חדשה הוא בדיקת קבלה למערכת. מדובר בבדיקה אחרונה במתכונת המערכת הנוכחית, שמטרתה הסופית לא תמיד זהה. יש כאלה שסבורים שמטרת בדיקת קבלה היא מציאת תקלות אחרונות שלא אובחנו עד כה. מפתחים אחרים חושבים שבדיקת הקבלה אמורה להיות סוג של חזרה גנרלית: הרצת המערכת בסביבה חדשה, בדרך כלל סביבתו של מזמין התוכנה, כדי לראות איך היא מתפקדת ב"לייב", כלומר בתנאים חדשים ובסביבת עבודה חדשה. מאחר ומדובר במערכת חדשה שמוטמעת בתוך מערכת קיימת, נושמת ובועטת, עלולות לצוץ בעיות שלא ניתן היה לנבא אותן מראש, ובדיקת קבלה מהווה הזדמנות נהדרת לעלות על כל התסריטים העתידיים שעלולים לגרום לכך שהמערכת תיתקע, תיקלע לעומס או תיצור קשיים בעבודה היומיומית של הלקוח.
